
Zvláště chráněné území, přírodní rezervace, v prostoru bývalé bažantnice na pravém břehu Otavy proti Novému Dražejovu. Vyhlášené roku 1985 na 22 ha za účelem zachování porostů lužního lesa, tzv. „tvrdého“ luhu (dub, jasan), na zbytcích hrůbat (sejpů) po těžbě zlata.

Více než šestihektarový rybník při zahrádkářské osadě v lokalitě Stará Valcha, napájený náhonovou stokou z řeky Volyňky a užívaný Českým rybářským svazem. V minulosti součástí rozsáhlého velkostatku patřícího johanitům.

Pramen s údajně léčivou vodou pod kapličkou Panny Marie, vystavěné koncem 18. století. Součást poutního místa kostela Panny Marie Bolestné na Podsrpu. Při komplexním rozboru vody v roce 2007 prokázán vyšší obsah radioaktivity (420 Bq/l). V ostatních ukazatelích splněny limity pro pitnou vodu. Obsah dusičnanů (pod 1 mg/l) hluboko pod normou pro kojeneckou vodu (15 mg/l).

Významné, esteticky cenné dřeviny dotvářejí ve všech ročních obdobích osobitý kolorit hradního příkopu s Hradním safari. Neobvyklý především více než stoletý dub, vyrůstající přímo ze skalního podloží, připomínající pověsti o strakonickém hradu.

Výrazný skalnatý výchoz s teplomilnou vegetací v západní části města před vjezdem do prostoru městského zahradnictví, psího útulku a čistírny odpadních vod. Podle pověsti kdysi také popravčí vrch, později hojně využívaný k těžbě stavebního materiálu. Na starších vedutách pod původním názvem Skalní vrch.

Náhon vedoucí od již neexistujícího mlýna U Pěti kol přes střed města a vytvářející lokalitu Ostrov. Část říčního ramene kolem kostela sv. Markéty zatrubněna. V roce 2005 nově revitalizován a doplněn vycházkovými a odpočinkovými trasami.

Poslední zachované dřeviny ze stromořadí, vysázeného ze Strakonic k poutnímu kostelu Panny Marie Bolestné na Podsrpu. Obvody kmenů 420 a 470 cm, výšky 26 a 29 m, stáří kolem 200 let. Negativně ovlivňovány stále vzrůstajícím silničním zatížením komunikace Strakonice–České Budějovice.

Dominantní, esteticky významná dřevina stáří cca 180 let nedaleko hlavní silnice Katovice–Strakonice, zhojená po přímém zásahu bleskem. S obvodem kmene přes 4 m a výškou téměř 30 m patří k nejmohutnějším stromům Strakonicka.

Nejmohutnější soliterní strom západní části strakonického Podskalí, obvod kmene 340 cm, výška 22 m, stáří 250 let. Pozůstatek lužního porostu levostranné údolní nivy Otavy. Výrazná dominanta území obstála i při náporu povodňové vlny v roce 2002.

Vzrostlá lípa, obvod kmene 350 cm, v zahrádkářské kolonii při západním okraji města, v prostoru bývalého hřbitova na Kalvárii. Podle pověsti vysazena vedle kaple sv. Kříže u hrobu populárního strakonického dudáka Švandy, jehož osudy posloužily Josefu Kajetánu Tylovi k sepsání divadelní hry Strakonický dudák aneb Hody divých žen (1847).

Nejstarší a nejmohutnější dřevina Strakonic u městského hřbitova s kostelem sv. Václava, u silnice Strakonice-České Budějovice. Podle pověsti vysazena na místě, kde byli v roce 1504 upáleni na příkaz vrchnosti a přes nesouhlas tehdejšího českého krále Vladislava Jagellonského tři Židé, obvinění z rituální vraždy malého chlapce. Obvod kmene 550 cm, výška 25 m, stáří 350-400 let.
Přirozená přírodní osa Strakonic i Prácheňska, dlouhá 113 km, proslulá rýžováním zlata a získáváním perel z perlorodek říčních. Vzniká soutokem Vydry a Křemelné u Čeňkovy Pily na Šumavě. Jméno z keltského výrazu Atawa znamená „bohatá voda“.

Nejprve horská říčka pramenící na Šumavě pod Světlou horou u Vimperka. Na horním toku nazývána pro náhlé a nebezpečné vzestupy vody při přívalových deštích Třeštilka. Ve Strakonicích se po 46 km vlévá do Otavy.

Nejrozsáhlejší městský park, založený roku 1837 v místech bývalého městského hradního příkopu při okraji města a doplněný empírovou besídkou k promenádním koncertům.

Významná ekologicko krajinářská a rybářská lokalita za čistírnou odpadních vod Strakonice s téměř neporušenou přírodou slepého ramene řeky Otavy (stulík bahenní, obojživelníci, ryby, ptáci...). Vyústění podzemní štoly zajišťující odvodnění strakonického viaduktu při přívalových deštích.

Romantická studánka pod vzrostlým smrkem s obrázkem Panny Marie, zahloubená v lesním svahu východní části vrchu Srpská. Průběžně čištěna žáky strakonických základních škol v rámci ekologického projektu U pramenů živé vody.

Významná a esteticky vysoce hodnotná dřevina u náhonu, stáří cca 100 let. Vzhledem k výskytu při frekventované ulici je stále monitorován a průběžně odborně ošetřován, neboť nepatří k dřevinám dlouhodobým.

Území v pravobřežní údolní nivě řeky Otavy, východně od města v k.ú. Hajská. Výrazně pozměněno činností člověka při rýžování zlata ve středověku.

Zbytek původně rozsáhlého krajinářského parku založeného v polovině 18. století západně od hradu. Později spolu s Kalvárií a Zellerinovou strání oblíbené výletní a promenádní místo. Ve 20. stol. vybudováno letní kino. Od roku 2005 postupná obnova a revitalizace parku v rámci rekonstrukce hradního areálu.